Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema4bQ62179 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema4bQ62179 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema4bQ62179 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms