Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctr9Q62018 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctr9Q62018 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms