Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mrc1Q61830 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Mrc1Q61830 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mrc1Q61830 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms