Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsg1aQ61495 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg1aQ61495 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg1aQ61495 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms