Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Msi1Q61474 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msi1Q61474 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msi1Q61474 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms