Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccna1Q61456 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccna1Q61456 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccna1Q61456 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccna1Q61456 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms