Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tsg101Q61187 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tsg101Q61187 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms