Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gata6Q61169 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gata6Q61169 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gata6Q61169 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms