Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a1Q61165 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a1Q61165 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc9a1Q61165 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms