Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpc6Q61143 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpc6Q61143 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms