Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Foxd3Q61060 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd3Q61060 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd3Q61060 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd3Q61060 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd3Q61060 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd3Q61060 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd3Q61060 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms