Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Laptm4aQ60961 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Laptm4aQ60961 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Laptm4aQ60961 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms