Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkn2cQ60772 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkn2cQ60772 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms