Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn11Q60771 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn11Q60771 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn11Q60771 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms