Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Csnk2a1Q60737 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk2a1Q60737 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a1Q60737 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms