Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Samhd1Q60710 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samhd1Q60710 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samhd1Q60710 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms