Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd4Q60688 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd4Q60688 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd4Q60688 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd4Q60688 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd4Q60688 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 569.1 ms