Protein–RNA interactions for Protein: Q60687

Fshb, Follitropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FshbQ60687 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FshbQ60687 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FshbQ60687 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FshbQ60687 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FshbQ60687 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FshbQ60687 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FshbQ60687 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FshbQ60687 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FshbQ60687 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FshbQ60687 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FshbQ60687 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FshbQ60687 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FshbQ60687 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms