Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr2f1Q60632 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr2f1Q60632 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr2f1Q60632 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr2f1Q60632 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nr2f1Q60632 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms