Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Satb1Q60611 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Satb1Q60611 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Satb1Q60611 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms