Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim38Q5SZ99 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
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Trim38Q5SZ99 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Trim38Q5SZ99 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Trim38Q5SZ99 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Trim38Q5SZ99 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim38Q5SZ99 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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