Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PfasQ5SUR0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PfasQ5SUR0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PfasQ5SUR0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms