Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd40Q5SUE8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd40Q5SUE8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms