Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc85aQ5SP85 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc85aQ5SP85 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc85aQ5SP85 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms