Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms