Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nsrp1Q5NCR9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsrp1Q5NCR9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsrp1Q5NCR9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms