Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sfmbt2Q5DTW2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfmbt2Q5DTW2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms