Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufaf2Q59J78 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufaf2Q59J78 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms