Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf354cQ571J5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf354cQ571J5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf354cQ571J5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf354cQ571J5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms