Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc84Q4VA36 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc84Q4VA36 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc84Q4VA36 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc84Q4VA36 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms