Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1nQ497L1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2al1nQ497L1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms