Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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