Protein–RNA interactions for Protein: Q3V053

4933427I04Rik, Riken cDNA 4933427I04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933427I04RikQ3V053 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933427I04RikQ3V053 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933427I04RikQ3V053 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933427I04RikQ3V053 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms