Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9Q3V038 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ttc9Q3V038 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc9Q3V038 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc9Q3V038 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms