Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SvipQ3UZP4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SvipQ3UZP4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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