Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUJ8

A230072I06Rik, RIKEN cDNA A230072I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A230072I06RikQ3UUJ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A230072I06RikQ3UUJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A230072I06RikQ3UUJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A230072I06RikQ3UUJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms