Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B230104I21RikQ3USW4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
B230104I21RikQ3USW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B230104I21RikQ3USW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms