Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm28047Q3US59 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm28047Q3US59 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28047Q3US59 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28047Q3US59 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms