Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Acsf3Q3URE1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acsf3Q3URE1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acsf3Q3URE1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms