Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfcp2l1Q3UNW5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfcp2l1Q3UNW5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfcp2l1Q3UNW5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfcp2l1Q3UNW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms