Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrch2Q3UMG5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrch2Q3UMG5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrch2Q3UMG5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms