Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB5

Smcr8, Guanine nucleotide exchange protein SMCR8, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smcr8Q3UMB5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smcr8Q3UMB5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smcr8Q3UMB5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smcr8Q3UMB5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms