Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upf3bQ3ULL6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Upf3bQ3ULL6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upf3bQ3ULL6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms