Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E330014E10RikQ3UL33 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E330014E10RikQ3UL33 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E330014E10RikQ3UL33 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms