Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3UJP5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q3UJP5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q3UJP5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3UJP5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UJP5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3UJP5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q3UJP5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UJP5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UJP5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UJP5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UJP5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3UJP5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms