Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf224Q3UIW8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf224Q3UIW8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnf224Q3UIW8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms