Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arfgef3Q3UGY8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arfgef3Q3UGY8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfgef3Q3UGY8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Arfgef3Q3UGY8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arfgef3Q3UGY8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arfgef3Q3UGY8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms