Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek10Q3UGM2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek10Q3UGM2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek10Q3UGM2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nek10Q3UGM2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek10Q3UGM2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek10Q3UGM2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek10Q3UGM2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms