Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmd8Q3UFK8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmd8Q3UFK8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmd8Q3UFK8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms