Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc10a4Q3UEZ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc10a4Q3UEZ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc10a4Q3UEZ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms